杭州市萧山区卫生健康局是杭州市萧山区人民政府工作部门，行政级别为正处级。该局与区计划生育协会机关合署办公，办公地址位于杭州市萧山区蜀山街道风情大道3258号。主要职责包括统筹规划卫生健康资源配置、推进医药卫生体制改革、实施疾病预防控制与卫生应急工作、落实国家基本药物制度、指导基层医疗卫生体系建设等，内设办公室、医政医管科、疾控与监督科等12个职能科室，下属区疾病预防控制中心、区第一人民医院等公共卫生及医疗机构。
根据《中共中央关于深化党和国家机构改革的决定》和《杭州市萧山区机构改革方案》要求组建，坚持党对卫生健康工作的集中统一领导，深化“三医联动”改革和区域医疗卫生服务共同体建设。2024年以来，推进浙大二院总部项目建设，完成区二医院迁建土建工程100%，建成15家“医防护”儿童健康管理中心。现任杭州市萧山区卫生健康局局长为俞国燕。
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